房地合一新制在去年上路，營利事業交易房屋、房屋及其坐落基地或依法得核發建造執照的土地，應依交易時點與持有期間來判斷適用新、舊制，以課徵所得稅。
財政部北區國稅局表示，若在2014年1月1日以前所交易的房地，就適用舊制。舊制的課稅方式，就是將房屋交易所得併入營利事業所得額課稅，且為境內營利事業或境外營利事業但有固定營業場所或代理人，其稅率就是17%；沒有固定營業場所就是按所得額20%扣繳率申報納稅。

新制房地合一的課稅範疇，是在2016年1月1日以後所交易的房地，或是在2014年1月2日以後取得，且持有期間在兩年以內，取得日、交易日的認定時點，是以房屋、土地「完成所有權移轉登記日」為準。

在新制下，該局說明，房屋、土地均應按實價計算交易所得，減除課徵土地增值稅的稅基（即土地漲價總數額），以其餘額課徵所得稅；至於已繳納的土增稅，則不得再列為營利事業成本費用或損失及扣抵所得稅。

對於新制課稅稅率，安永聯合會計師事務所會計師楊建華表示，若營利事業總機構在中華民國境內，就以17%的稅率計算；若總機構在中華民國境外，持有期間為一年以內者稅率45%、超過一年為稅率35%，在境內有固定營業場所者，為分開計算稅額、合併報繳，若無就是代理申報納稅。

營利事業依新制計算房地交易時，當年度交易二筆以上的房地者，應逐筆計算。如房地交易所得額為正數，就以減掉土地漲價總數額的餘額計算課稅所得；但若減除土地漲價總數額後，餘額是負數者，就以「零」計入營利事業所得額。而若房地交易所得為損失者，可自營利事業所得額中減除，但不得減除土地漲價總數額。該局舉例，甲公司在2016年1月2日取得甲、乙、丙三筆房地，同年6月30日全數出售，房地交易所得額分別為1,600萬元、30萬元及-20萬元，若土地漲價總數額皆為50萬元，計算三筆房地應計入營利事業所得額就分別為1,550萬元、0元、-20萬元，合計為1,530萬元。